お寺めぐりの友 The guide for exploring Buddhism facilities in western Japan  

Links① によれば、 白鳳2年₆₆₂2月隆慶国師の開創。 もと高良大社の神宮寺を高隆寺といい、のち全く神佛混淆し近世に至る。 その間、高良山中腹に位置し盛時には山内26ヶ寺360坊1000余名の衆徒を擁し、 高良座主と称してすこぶる勢力を有した。

明治初年の動乱期に本坊(蓮台院御井寺)はじめ山内のすべての堂塔が取り除かれ、 第59世座主職も廃せられる。 第58世座主亮純権僧正の附弟、比叡山真蔵院住職甘井亮憲僧正は当寺を兼務し、 御井寺復興を嘆願、旧来格別の寺格につきようやく明治3年₁₈₇₁復興が許可された。 明治11年₁₈₇₉4月、旧、宝蔵寺跡に当寺が造営され現在に至っているという。